Les Partenariats Européens issus du programme Horizon Europe, ainsi que ceux encore en cours issus du programme H2020 (ERA-NETs, EJPs et JPI) sont des programmes internationaux qui soutiennent la recherche transnationale dans une thématique donnée. Les agences nationales et régionales de financement, telles que l’ANR, participent à ces programmes en lançant conjointement des appels à projets ou des appels à réseaux transnationaux.
L'ANR est présente dans différents instruments de financement en santé qui lancent des appels à projets listés dans le tableau ci-dessous :